Январь 1999 года — ещё одна новинка от Lexus: компактный спорт-седан IS200, показанный в Детройте. В марте того же года пятый год подряд Lexus лидирует в рейтинге J. D. Power and Associates, отображающем наименьшее количество проблем после 5 лет эксплуатации автомобиля.
Двумя месяцами позже, в ноябре, компания отметила ещё один юбилей — в Штатах был продан миллионный автомобиль Lexus. В декабре, подведя итоги года, компания убедилась в том, что можно отпраздновать ещё и то, что продажи в США растут уже четвёртый год подряд; к тому же за 1999 год больше чем в два раза выросли европейские продажи. Львиную долю из проданных за год в Европе автомобилей Lexus составила новая модель IS200.
Начало 2000 года, как уже стало привычным, было отмечено обновлениями. В январе в Лос-Анжелесе Lexus демонстрирует вариацию на тему быстро ставшей популярной IS200 — IS300, а в Детройте выставляется реинкарнация легендарной для компании модели LS400 — LS430. Новый флагман модельного ряда был оснащён по последнему слову техники и дизайна: система навигации, DVD, кожа и ореховое дерево в салоне, двигатель V8 объёмом 4300 сс, 280 лошадиных сил и 417 Nm крутящего момента, разгон до 100 км/ч за 6,7 секунды, 5-ступенчатая АКПП. Ко всему прочему, LS430 имел наименьший коэффициент лобового сопротивления среди автомобилей своего класса.
В апреле 2000 года на автошоу в Нью-Йорке Lexus анонсировало скорое появление модели SC430. В этом же месяце компания объявила о том, что к 2003 году RX300 будет выпускаться на автозаводе Toyota в Канаде. В июне IS300 поступает в продажу, в августе Lexus становится первым в США импортным люксовым брендом, продавшим более 20000 экземпляров своих автомобилей за месяц, в сентябре на смену GS400 приходит модель GS430. В октябре пошёл в серию LS430. Итоги 2000 года показали, что и в этот раз Lexus увеличил свои продажи, опередив все остальные люксовые бренды на автомобильном рынке США.